RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 IQCA1Q86XH1 822 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 MTA3Q9BTC8 594 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 CABP5Q9NP86 173 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 GINM1Q9NU53 330 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 NEK4P51957 841 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 TMEM87BQ96K49 555 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 SENP2Q9HC62 589 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 ICA1Q05084 483 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 ANKS1AQ92625 1134 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 LY9Q9HBG7 655 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGAE-202ENST00000570360 PARP14Q460N5 1801 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 PTPRAP18433 802 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 Q6ZUG5 572 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 FBXL16Q8N461 479 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 CSADQ9Y600 493 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 UNCXA6NJT0 531 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 AK2P54819 239 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 DGKHQ86XP1 1220 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 PICK1Q9NRD5 415 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 NYAP2Q9P242 653 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 USP17L5A8MUK1 530 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 TTLL1O95922 423 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 WTAPQ15007 396 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ELP3Q9H9T3 547 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 STX8Q9UNK0 236 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 A0A1W2PRG0 241 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ERICH2A1L162 156 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 LIFRP42702 1097 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ACER1Q8TDN7 264 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 BRF1Q92994 677 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ECE1P42892 770 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 MKL1Q969V6 931 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 WDR18Q9BV38 432 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 GJA5P36382 358 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 HUNKP57058 714 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 EVCP57679 992 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 FGD1P98174 961 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ATP2B2Q01814 1243 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 APOBRQ0VD83 1088 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ERO1BQ86YB8 467 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 IL27Q8NEV9 243 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 TMX2Q9Y320 296 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGAE-202ENST00000570360 ST18O60284 1047 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 PPATQ06203 517 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 APOA5Q6Q788 366 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 TMTC2Q8N394 836 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 PNMA1Q8ND90 353 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 OPTNQ96CV9 577 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 MYH6P13533 1939 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 RLFQ13129 1914 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 PPIL2Q13356 520 aa20■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 ANKRD1Q15327 319 aa20■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ITGAE-202ENST00000570360 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms