RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565243.2

RNPS1-213, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 3,337 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-213	ENST00000565243	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	PKN1	Q16512	942 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	MTR	Q99707	1265 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	PDE8B	O95263	885 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	CTSW	P56202	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	ALX1	Q15699	326 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	TFR2	Q9UP52	801 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	FGFR2	P21802	821 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	FECH	P22830	423 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	USP5	P45974	858 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	NPY5R	Q15761	445 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	CDC23	Q9UJX2	597 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-213	ENST00000565243	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	EVX2	Q03828	476 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	MCM6	Q14566	821 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	RTN1	Q16799	776 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	XDH	P47989	1333 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	ABCA3	Q99758	1704 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	LMAN1	P49257	510 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	AMPD2	Q01433	879 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	SLC20A2	Q08357	652 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	FUT2	Q10981	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	BRD3	Q15059	726 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	IL17A	Q16552	155 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	NAPB	Q9H115	298 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	VPS18	Q9P253	973 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	DEXI	O95424	95 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	SEC23A	Q15436	765 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	TAF1	P21675	1872 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	WTAP	Q15007	396 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	KRT31	Q15323	416 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	E2F4	Q16254	413 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	CHP1	Q99653	195 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	DISP2	A7MBM2	1401 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-213	ENST00000565243	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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