RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 KIF27Q86VH2 1401 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 CDC45O75419 566 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 BBS9Q3SYG4 887 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 LCE2CQ5TA81 110 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 FDX2Q6P4F2 183 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.44□□□□□ -1.06
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TMOD3-208ENST00000560725 EPN3Q9H201 632 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 PIDD1Q9HB75 910 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.43□□□□□ -1.06
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TMOD3-208ENST00000560725 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.43□□□□□ -1.06
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TMOD3-208ENST00000560725 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.43□□□□□ -1.06
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TMOD3-208ENST00000560725 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.43□□□□□ -1.06
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TMOD3-208ENST00000560725 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.43□□□□□ -1.06
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TMOD3-208ENST00000560725 TTLL4Q14679 1199 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 LILRB2Q8N423 598 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 TMX1Q9H3N1 280 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-208ENST00000560725 RGS13O14921 159 aa8.41□□□□□ -1.06
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TMOD3-208ENST00000560725 ISL2Q96A47 359 aa8.4□□□□□ -1.06
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TMOD3-208ENST00000560725 FAM229AH3BQW9 127 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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TMOD3-208ENST00000560725 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-208ENST00000560725 KIF2CQ99661 725 aa8.38□□□□□ -1.07
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