RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FGRP09769 529 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CETPP11597 493 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MCCP23508 829 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GTF2A2P52657 109 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ICA1Q05084 483 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SNAPC2Q13487 334 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NCOA7Q8NI08 942 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FEZ1Q99689 392 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WDR18Q9BV38 432 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP26Q9BXU7 913 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C19orf81C9J6K1 198 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L10C9JJH3 530 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GUCY1A2P33402 732 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAP2K2P36507 400 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 INHBEP58166 350 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SREBF2Q12772 1141 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MTMR2Q13614 643 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCL15Q16663 113 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C8orf34Q49A92 452 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IQCA1Q86XH1 822 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ACER1Q8TDN7 264 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZIC5Q96T25 663 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SH2D4AQ9H788 454 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CLIP2Q9UDT6 1046 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RAD21O60216 631 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NMT2O60551 498 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SEC24BO95487 1268 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TTLL1O95922 423 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HSPA4P34932 840 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NT5C2P49902 561 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP14P54578 494 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HMGCS2P54868 508 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BACE1P56817 501 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KRT32Q14532 448 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCDC178Q5BJE1 867 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CEP95Q96GE4 821 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UBAC1Q9BSL1 405 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NYAP2Q9P242 653 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 STX8Q9UNK0 236 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A1W2PRG0 241 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ERICH2A1L162 156 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MCM5P33992 734 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TM4SF4P48230 202 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHST3Q7LGC8 479 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RASEFQ8IZ41 740 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NEK1Q96PY6 1258 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GOPCQ9HD26 462 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMX2Q9Y320 296 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.27□□□□□ -1.08
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BTBD19C9JJ37 291 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRC1O43663 620 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms