RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 ABCB5Q2M3G0 1257 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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COCH-211ENST00000557065 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.9□□□□□ -0.82
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COCH-211ENST00000557065 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
COCH-211ENST00000557065 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.88□□□□□ -0.83
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COCH-211ENST00000557065 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.86□□□□□ -0.83
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COCH-211ENST00000557065 STRNO43815 780 aa9.85□□□□□ -0.83
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COCH-211ENST00000557065 ATP5JP18859 108 aa9.85□□□□□ -0.83
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COCH-211ENST00000557065 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.85□□□□□ -0.83
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COCH-211ENST00000557065 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
COCH-211ENST00000557065 BMP8BP34820 402 aa9.84□□□□□ -0.83
COCH-211ENST00000557065 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.84□□□□□ -0.83
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