RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557061.5

PAPLN-210, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, human

TSL 1 (best)

Gene PAPLN, Length 3,709 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPLN-210	ENST00000557061	MECOM	Q03112	1051 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	KRT32	Q14532	448 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	STX1A	Q16623	288 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	ST7	Q9NRC1	585 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	NECTIN1	Q15223	517 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	MXD3	Q9BW11	206 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	CYP21A2	P08686	494 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	YY1	P25490	414 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	SCARF1	Q14162	830 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	UBE3C	Q15386	1083 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	UBXN4	Q92575	508 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	SBF2	Q86WG5	1849 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	SCRN1	Q12765	414 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	MAP4K1	Q92918	833 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	STX8	Q9UNK0	236 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	SMTNL1	A8MU46	457 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	FGFR2	P21802	821 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	MYL10	Q9BUA6	226 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	PICK1	Q9NRD5	415 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	TJP1	Q07157	1748 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	TRIM29	Q14134	588 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	EPC1	Q9H2F5	836 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	CSAD	Q9Y600	493 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	NFKBIE	O00221	500 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	TSPY3	P0CV98	308 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	TSPY8	P0CW00	308 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	CACNB3	P54284	484 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	ST3GAL1	Q11201	340 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	GPC2	Q8N158	579 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	ZNF609	O15014	1411 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	ADD2	P35612	726 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PAPLN-210	ENST00000557061	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	CSRNP1	Q96S65	589 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	EPHX2	P34913	555 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	ESR2	Q92731	530 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	NUP98	P52948	1817 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	USP17L12	C9JPN9	530 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	USP17L21	D6R901	530 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	PHKB	Q93100	1093 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	KCNA4	P22459	653 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	AIFM3	Q96NN9	605 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	GGA3	Q9NZ52	723 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	IL1R1	P14778	569 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	UBASH3A	P57075	661 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	CCDC96	Q2M329	555 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	KRT222	Q8N1A0	295 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	NDUFA8	P51970	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	GNG11	P61952	73 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PAPLN-210	ENST00000557061	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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