RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556838.5

RBM23-223, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-223	ENST00000556838	TREML2	Q5T2D2	321 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	CPA4	Q9UI42	421 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	TRIM17	Q9Y577	477 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	GNRH1	P01148	92 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PDE4A	P27815	886 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	GUCY1A2	P33402	732 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	C12orf42	Q96LP6	360 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	FAM227B	Q96M60	508 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	SH2D4A	Q9H788	454 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838		A0A0D9SFI3	127 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	NEFL	P07196	543 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	BCR	P11274	1271 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	AKR1B1	P15121	316 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	CAP1	Q01518	475 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PDE4B	Q07343	736 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ALX1	Q15699	326 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	TTC22	Q5TAA0	569 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	BRCA2	P51587	3418 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	HOXD10	P28358	340 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PRMT2	P55345	433 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ICA1	Q05084	483 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ACER1	Q8TDN7	264 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	USP17L15	C9J2P7	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	USP17L11	C9JVI0	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	USP17L18	D6R9N7	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	USP17L22	D6RA61	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	USP17L19	D6RCP7	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	USP17L20	D6RJB6	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	SMIM22	K7EJ46	135 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	SLC34A2	O95436	690 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PSMC4	P43686	418 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PPARA	Q07869	468 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	USP17L24	Q0WX57	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	TMX2	Q9Y320	296 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	RASA1	P20936	1047 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	FCGRT	P55899	365 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	VPS53	Q5VIR6	699 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	LPAR1	Q92633	364 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ZMYM6	O95789	1325 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838		A0A1W2PRG0	241 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	VCAM1	P19320	739 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	HERVK_113	P62684	666 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ATP2B2	Q01814	1243 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-223	ENST00000556838	PTPRF	P10586	1907 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	FOXP2	O15409	715 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	FGA	P02671	866 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	TSPY3	P0CV98	308 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	TSPY8	P0CW00	308 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	TRIM47	Q96LD4	638 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-223	ENST00000556838	VCPKMT	Q9H867	229 aa		14.7	□□□□□ -0.06

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