RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	NCOA4	Q13772	614 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	STYK1	Q6J9G0	422 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	FAM227B	Q96M60	508 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	EYA3	Q99504	573 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	RAI14	Q9P0K7	980 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PPFIA3	O75145	1194 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	UFL1	O94874	794 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	IL2RA	P01589	272 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SRGN	P10124	158 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PSMA5	P28066	241 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	HSPA4	P34932	840 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	MCAM	P43121	646 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	GYG1	P46976	350 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	MCM2	P49736	904 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	GPSM2	P81274	684 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	RASGRF1	Q13972	1273 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	KRT32	Q14532	448 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	UBE3C	Q15386	1083 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	APPBP2	Q92624	585 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	AIDA	Q96BJ3	306 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	UCN2	Q96RP3	112 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ABCF2	Q9UG63	623 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	NOD1	Q9Y239	953 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	LRP5	O75197	1615 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0D9SFI3	127 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SNAP23	O00161	211 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	APP	P05067	770 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	GNAT2	P19087	354 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	GDF10	P55107	478 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	GTF2I	P78347	998 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	GSTO1	P78417	241 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	POU4F2	Q12837	409 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SNX21	Q969T3	373 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	USP17L3	A6NCW0	530 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	USP17L4	A6NCW7	530 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067		H3BM21	787 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ATP9B	O43861	1147 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	LDHC	P07864	332 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PDE6A	P16499	860 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CYP7A1	P22680	504 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	GPC1	P35052	558 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ADD2	P35612	726 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PHKA2	P46019	1235 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	NEK4	P51957	841 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CENPC	Q03188	943 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	TLR1	Q15399	786 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SOGA3	Q5TF21	947 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PI16	Q6UXB8	463 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	MAP4K1	Q92918	833 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	IRF7	Q92985	503 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	MTFR1L	Q9H019	292 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SPEF2	Q9C093	1822 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	MED23	Q9ULK4	1368 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	MAST3	O60307	1309 aa		6.59	□□□□□ -1.35

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