RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553732.1

TGFB3-AS1-201, TGFB3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TGFB3-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 JAG1P78504 1218 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TFF2Q03403 129 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 USP17L24Q0WX57 530 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 AAK1Q2M2I8 961 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TEX11Q8IYF3 940 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SIL1Q9H173 461 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MSRAQ9UJ68 235 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.56□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DOCK2Q92608 1830 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CNMDO75829 334 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MECOMQ03112 1051 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GRB14Q14449 540 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCDC27Q2M243 656 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCDC102BQ68D86 513 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SNX27Q96L92 541 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IL16Q14005 1332 aa9.55□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LTBP2Q14767 1821 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ADORA1P30542 326 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KCNQ1P51787 676 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GSTO1P78417 241 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCDC174Q6PII3 467 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FEZ1Q99689 392 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 BTBD7Q9P203 1132 aa9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 APBB1O00213 710 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PGK1P00558 417 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TIMP1P01033 207 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ACRP10323 421 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RARBP10826 455 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ADORA2AP29274 412 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TIMM10P62072 90 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAAP100Q0VG06 881 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RASGRF1Q13972 1273 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RAB30Q15771 203 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TMEM240Q5SV17 173 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RNF180Q86T96 592 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RAI14Q9P0K7 980 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PHF24Q9UPV7 400 aa9.53□□□□□ -0.88
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 STRNO43815 780 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GPR37L1O60883 481 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COBLO75128 1261 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MFSD5Q6N075 450 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF365Q70YC5 407 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GINM1Q9NU53 330 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.52□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 A0A1W2PQY0 241 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SMIM22K7EJ46 135 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GH2P01242 217 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CSF2RAP15509 400 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MRE11P49959 708 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TMEM199Q8N511 208 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF384Q8TF68 577 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HERVK_113Q902F9 699 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TOX2Q96NM4 488 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 UIMC1Q96RL1 719 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 USP44Q9H0E7 712 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PALD1Q9ULE6 856 aa9.51□□□□□ -0.89
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RLFQ13129 1914 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms