RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 RASA1P20936 1047 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 DGKZQ13574 1117 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 PARP14Q460N5 1801 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 RAD50Q92878 1312 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-208ENST00000531226 TLR2O60603 784 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 FKTNO75072 461 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 FGAP02671 866 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 CHMLP26374 656 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 TREML2Q5T2D2 321 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 FEZ1Q99689 392 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE4BQ07343 736 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 ACER1Q8TDN7 264 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 IL25Q9H293 177 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 USP14P54578 494 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 ICA1Q05084 483 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 C12orf42Q96LP6 360 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 PNMA3Q9UL41 463 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 PRDM1O75626 825 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2C8P10632 490 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PRG0 241 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 SP3Q02447 781 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 C17orf99Q6UX52 265 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 RLFQ13129 1914 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 ERO1AQ96HE7 468 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 OSBPP22059 807 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 SH2D4AQ9H788 454 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 CPA4Q9UI42 421 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 TMX2Q9Y320 296 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-208ENST00000531226 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 FGRP09769 529 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 HAND2P61296 217 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 SGSM2O43147 1006 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 ORC4O43929 436 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPY3P0CV98 308 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPY8P0CW00 308 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 BCRP11274 1271 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 VCAM1P19320 739 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 TNS4Q8IZW8 715 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF3Q9H094 633 aa22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 TFAP4Q01664 338 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP2B2Q01814 1243 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 INCENPQ9NQS7 918 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 NYAP2Q9P242 653 aa22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF213O14771 459 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 LPAR1Q92633 364 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP95Q96GE4 821 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 VCPKMTQ9H867 229 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPY2A6NKD2 308 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L15C9J2P7 530 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L11C9JVI0 530 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L18D6R9N7 530 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L22D6RA61 530 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L19D6RCP7 530 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L20D6RJB6 530 aa22.53■■□□□ 1.2
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