RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 ERICH2A1L162 156 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 NMT2O60551 498 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 SEPT2Q15019 361 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 VGLL4Q14135 290 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 PICK1Q9NRD5 415 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 NYAP2Q9P242 653 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 CSADQ9Y600 493 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 ST18O60284 1047 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 TTLL1O95922 423 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD1Q15327 319 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 LY9Q9HBG7 655 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 DOCK1Q14185 1865 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 EVCP57679 992 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 ICA1Q05084 483 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 Q6ZUG5 572 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 MOB2Q70IA6 237 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 MKL1Q969V6 931 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 USP17L5A8MUK1 530 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPRAP18433 802 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 WTAPQ15007 396 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 OTOFQ9HC10 1997 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 FGD1P98174 961 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR18Q9BV38 432 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 STX8Q9UNK0 236 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-205ENST00000528462 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 AK2P54819 239 aa25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 BRF1Q92994 677 aa25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 MCM2P49736 904 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 ERO1BQ86YB8 467 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM47Q9BQJ4 181 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 TMX2Q9Y320 296 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 SH2D4AQ9H788 454 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 SENP2Q9HC62 589 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 RCAN1P53805 252 aa25.79■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 PPATQ06203 517 aa25.79■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.79■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX21Q969T3 373 aa25.79■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.79■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 KAT14Q9H8E8 782 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PRG0 241 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC69A6NI79 296 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 APOA5Q6Q788 366 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 PNMA1Q8ND90 353 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 ACER1Q8TDN7 264 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 HUNKP57058 714 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 TROAPQ12815 778 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 ELP3Q9H9T3 547 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP2B2Q01814 1243 aa25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3-205ENST00000528462 APOBRQ0VD83 1088 aa25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3-205ENST00000528462 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3-205ENST00000528462 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3-205ENST00000528462 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP3K14Q99558 947 aa25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms