RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 NPHS2Q9NP85 383 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 RAD18Q9NS91 495 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 FZD5Q13467 585 aa6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 TMC4Q7Z404 712 aa6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 FLCNQ8NFG4 579 aa6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ASIC4Q96FT7 647 aa6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 CORO1BQ9BR76 489 aa6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 NWD1Q149M9 1564 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ECEL1O95672 775 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 B3GALT4O96024 378 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ITGB5P18084 799 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 VAMP1P23763 118 aa6.23□□□□□ -1.41
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HDAC2-216ENST00000523628 LCE1DQ5T752 114 aa6.23□□□□□ -1.41
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 BACH2Q9BYV9 841 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 PIK3C2BO00750 1634 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 DCCP43146 1447 aa6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 NEFLP07196 543 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 GNA15P30679 374 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 GRM2Q14416 872 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF576Q9H609 170 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.21□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 TRPM2O94759 1503 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 E9PSI1 815 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 AOC2O75106 756 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 ITPKAP23677 461 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 AK5Q9Y6K8 562 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 MSH6P52701 1360 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 KCNA6P17658 529 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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HDAC2-216ENST00000523628 FBF1Q8TES7 1133 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 WDR18Q9BV38 432 aa6.2□□□□□ -1.42
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HDAC2-216ENST00000523628 EHD4Q9H223 541 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.19□□□□□ -1.42
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HDAC2-216ENST00000523628 AP3B2Q13367 1082 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 PDE3AQ14432 1141 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 TBX22Q9Y458 520 aa6.19□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 ZFYVE9O95405 1425 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 ATP2B2Q01814 1243 aa6.18□□□□□ -1.42
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HDAC2-216ENST00000523628 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf49Q9H741 205 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 LGR6Q9HBX8 967 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 ABCB6Q9NP58 842 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 KIF1BO60333 1816 aa6.18□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 HFM1A2PYH4 1435 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 E9PCH4 1651 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 TMPRSS2O15393 492 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 SORBS3O60504 671 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 C8AP07357 584 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 JAG1P78504 1218 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 IDI1Q13907 227 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.17□□□□□ -1.42
HDAC2-216ENST00000523628 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
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