RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 KIF5BP33176 963 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 NR5A1Q13285 461 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKS1AQ92625 1134 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 MAP3K14Q99558 947 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 CTAGE5O15320 804 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 STX8Q9UNK0 236 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP6R2O75170 966 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 NDUFA8P51970 172 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 PTPAQ15257 358 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 JMYQ8N9B5 988 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 OXER1Q8TDS5 423 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 USP40Q9NVE5 1235 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 CMA1P23946 247 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 TEKT1Q969V4 418 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 SHISA4Q96DD7 197 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 SDF4Q9BRK5 362 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 CABP5Q9NP86 173 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 USP25Q9UHP3 1055 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 MTMR7Q9Y216 660 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 KRT2P35908 639 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 BAG6P46379 1132 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 ECE2O60344 883 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 PLCB2Q00722 1185 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 ATP2B1P20020 1258 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF202O95125 648 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 SCG2P13521 617 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 PFKFB1P16118 471 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 CLIC6Q96NY7 704 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 SLX4Q8IY92 1834 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 CRKP46108 304 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 GNAQP50148 359 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 GRM4Q14833 912 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 AOC3Q16853 763 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-204ENST00000519651 SHC4Q6S5L8 630 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 MYH6P13533 1939 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 C21orf2O43822 256 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 CUTAO60888 179 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 NLRP5P59047 1200 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 CEP95Q96GE4 821 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 CBX8Q9HC52 389 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 SNED1Q8TER0 1413 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 DACT2Q5SW24 774 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 LUZP1Q86V48 1076 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 ESPNB1AK53 854 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 ADCY5O95622 1261 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 SYKP43405 635 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF165P49910 485 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 GABPAQ06546 454 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 MYH1P12882 1939 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-204ENST00000519651 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms