RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 CASP7P55210 303 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 CYP7A1P22680 504 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 CHMP4BP1P59074 171 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXL6Q8N531 539 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC9A7Q96T83 725 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIF2CQ99661 725 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATG3Q9NT62 314 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 F13BP05160 661 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACRP10323 421 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 ETFBP38117 255 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 SOGA3Q5TF21 947 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 NBPF4Q96M43 638 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 LEFTY1O75610 366 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 UBOX5O94941 541 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 EOMESO95936 686 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 TTC6Q86TZ1 520 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A1W2PQH9 124 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM170BA6NMN3 283 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 WDR64B1ANS9 1081 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF4P78317 190 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 RBL2Q08999 1139 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP2R5EQ16537 467 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 BBS9Q3SYG4 887 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF141Q8WVD5 230 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 ASPNQ9BXN1 380 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLEC3AO75596 197 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 FURINP09958 794 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIR3DL1P43629 444 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDH24Q86UP0 819 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 RIN3Q8TB24 985 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 USP35Q9P2H5 1018 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM214BQ7L5A3 538 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 KREMEN1Q96MU8 473 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC6A18Q96N87 628 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLF4O43474 513 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 FXNQ16595 210 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 SHISA5Q8N114 240 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXL18Q96ME1 805 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIM2Q9P1W9 311 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAB33AQ14088 237 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM192Q8IY95 271 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 NCAPHQ15003 741 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 VWCEQ96DN2 955 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms