RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC9Q92623 222 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FGD4Q96M96 766 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP26Q9BXU7 913 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C9IYK1 514 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FSCN2O14926 492 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF3BO15066 747 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST8SIA5O15466 376 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DGAT1O75907 488 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EYA4O95677 639 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCGB1D2O95969 90 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADH6P28332 368 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GBP1P32455 592 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNALP38405 381 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRIA2P42262 883 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCL1Q07820 350 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BIRC2Q13490 618 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP7Q14244 749 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP9Q49MG5 647 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPM1JQ5JR12 505 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NSMFQ6X4W1 530 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HAUS7Q99871 368 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BAG6P46379 1132 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB27AP51159 221 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEK4P51957 841 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NLRP12P59046 1061 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITKQ08881 620 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MMRN1Q13201 1228 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRIK5Q16478 980 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMC5Q8IY18 1101 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNT8BQ93098 351 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RELTQ969Z4 430 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTMR8Q96EF0 704 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM87BQ96K49 555 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM83GA6ND36 823 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGS13O14921 159 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBX1O43435 398 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBOX5O94941 541 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLFN14P0C7P3 912 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FGFR1P11362 822 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATF3P18847 181 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MX2P20592 715 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEK2P51955 445 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTMR1Q13613 665 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCAF15Q66K64 600 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRAPQ7Z569 592 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C14orf80Q86SX3 495 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AHI1Q8N157 1196 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR18Q9BV38 432 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CBFA2T2O43439 604 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OPA1O60313 960 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KPNA6O60684 536 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AOC2O75106 756 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLEC3AO75596 197 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RING1Q06587 406 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms