RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515574.1

USP17L27-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 27, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L27, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L27-201ENST00000515574 USP17L12C9JPN9 530 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 USP17L21D6R901 530 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 CXCL11O14625 94 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 INPP5BP32019 993 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 SREBF2Q12772 1141 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 CTR9Q6PD62 1173 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 IFNL3Q8IZI9 196 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 CCDC17Q96LX7 622 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 DNAJC18Q9H819 358 aa11.97□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 PLCD1P51178 756 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 GTF2A2P52657 109 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 Q6ZUG5 572 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 GTF3C6Q969F1 213 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 CHMP4CQ96CF2 233 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 OPTNQ96CV9 577 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 WDR18Q9BV38 432 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 PICK1Q9NRD5 415 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 WBP1LQ9NX94 342 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 SAGE1Q9NXZ1 904 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 FZD1Q9UP38 647 aa11.96□□□□□ -0.49
USP17L27-201ENST00000515574 ZNF213O14771 459 aa11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 ALDH1A1P00352 501 aa11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 PCP11498 1178 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 PTPRAP18433 802 aa11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 SHMT1P34896 483 aa11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 EVCP57679 992 aa11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 NCOA7Q8NI08 942 aa11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 ELP3Q9H9T3 547 aa11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.96□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 PHIPQ8WWQ0 1821 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 FGRP09769 529 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 PDCP20941 246 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 GJB2P29033 226 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 MCM5P33992 734 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 GJA5P36382 358 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 SNAPC2Q13487 334 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 NAPBQ9H115 298 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 MYH6P13533 1939 aa11.95□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 MYH8P13535 1937 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 USP17L5A8MUK1 530 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 STX6O43752 255 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 TRAK2O60296 914 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 PFKFB2O60825 505 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 AOC2O75106 756 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 APPP05067 770 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 CETPP11597 493 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 TDO2P48775 406 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 GSE1Q14687 1217 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 BRF1Q92994 677 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 NBPF3Q9H094 633 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 CABP5Q9NP86 173 aa11.94□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 IRF6O14896 467 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 SYT1P21579 422 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 CDK8P49336 464 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 FGD1P98174 961 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 TRDNQ13061 729 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 PTPRFP10586 1907 aa11.93□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 FAM196BA6NMK8 535 aa11.92□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 C19orf81C9J6K1 198 aa11.92□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 CYP2D6P10635 497 aa11.92□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 HAND2P61296 217 aa11.92□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 PDE4BQ07343 736 aa11.92□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 PPARAQ07869 468 aa11.92□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.92□□□□□ -0.5
USP17L27-201ENST00000515574 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms