RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 LTBP2Q14767 1821 aa21.99■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 CNMDO75829 334 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 RGS2P41220 211 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 PDE3AQ14432 1141 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 APBA2Q99767 749 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 GH2P01242 217 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 USP5P45974 858 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 CEP85Q6P2H3 762 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 CERS3Q8IU89 383 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 UNC80Q8N2C7 3258 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 RLFQ13129 1914 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 MAP3K12Q12852 859 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 MAP2K5Q13163 448 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 C12orf42Q96LP6 360 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 EHD4Q9H223 541 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 AACSQ86V21 672 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 TTC6Q86TZ1 520 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 FEZ1Q99689 392 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 POTEB2H3BUK9 544 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L15C9J2P7 530 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L11C9JVI0 530 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L18D6R9N7 530 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L22D6RA61 530 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L19D6RCP7 530 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L20D6RJB6 530 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 IGHA2P01877 340 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 PLCD1P51178 756 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L24Q0WX57 530 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 PANK1Q8TE04 598 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 GUCD1Q96NT3 240 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 BTBD7Q9P203 1132 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 PTPREP23469 700 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 SHMT1P34896 483 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 MIER1Q8N108 512 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 TRPV1Q8NER1 839 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 ACER1Q8TDN7 264 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-215ENST00000515147 MYH8P13535 1937 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 HOXC6P09630 235 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 VCAM1P19320 739 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 USP14P54578 494 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 LBX2Q6XYB7 198 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 CABP5Q9NP86 173 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 GRB14Q14449 540 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 PARP14Q460N5 1801 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 CYP2C19P33261 490 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 GUCY1A2P33402 732 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 CCNA1P78396 465 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 LPAR1Q92633 364 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 PDE6AP16499 860 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 EVX2Q03828 476 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-215ENST00000515147 GABPAQ06546 454 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms