RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TM4SF5O14894 197 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 FSCN2O14926 492 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TBX1O43435 398 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CBFA2T2O43439 604 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 UBOX5O94941 541 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ADH6P28332 368 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 GRIA2P42262 883 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ARL4DP49703 201 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 RHBDL3P58872 404 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PPP2R5AQ15172 486 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 BBS9Q3SYG4 887 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PPM1JQ5JR12 505 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 WNT8BQ93098 351 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 RELTQ969Z4 430 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 WDR18Q9BV38 432 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 USP26Q9BXU7 913 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 AAASQ9NRG9 546 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SHTN1A0MZ66 631 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PRODHO43272 600 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 RASGRP1O95267 797 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SCGB1D2O95969 90 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CAPNS1P04632 268 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 FGFR1P11362 822 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 GNALP38405 381 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 OSBP2Q969R2 916 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TMEM87BQ96K49 555 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 FGD4Q96M96 766 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 RGS13O14921 159 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 DLGAP3O95886 979 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NAT2P11245 290 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NTF4P34130 210 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NLRP12P59046 1061 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 STRN3Q13033 797 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 MTMR1Q13613 665 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 MAP7Q14244 749 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 MAP9Q49MG5 647 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 BRAPQ7Z569 592 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ELOA3Q8NG57 546 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 APBA2Q99767 749 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 FBRSQ9HAH7 460 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 AOC2O75106 756 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 MX2P20592 715 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NEK2P51955 445 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 GAS6Q14393 721 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 ZNF460Q14592 562 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 DCAF15Q66K64 600 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 NSMFQ6X4W1 530 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-209ENST00000504994 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms