RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-215	ENST00000502470	MTFR1	Q15390	333 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	OSBP2	Q969R2	916 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	APPBP2	Q92624	585 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	ERC2	O15083	957 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	COA7	Q96BR5	231 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-215	ENST00000502470	MX1	P20591	662 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP14	P54578	494 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	CTR9	Q6PD62	1173 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	ADCY3	O60266	1144 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	CDK8	P49336	464 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470		A0A1W2PRG0	241 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	AKR1B1	P15121	316 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	VCAM1	P19320	739 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	IRF5	Q13568	498 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	GCC1	Q96CN9	775 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L15	C9J2P7	530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L11	C9JVI0	530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L18	D6R9N7	530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L22	D6RA61	530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L19	D6RCP7	530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L20	D6RJB6	530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470		M0R2C6	588 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	ELN	P15502	786 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	USP17L24	Q0WX57	530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	RLF	Q13129	1914 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	GPAA1	O43292	621 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470		Q3C1V9	767 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-215	ENST00000502470	CCL5	P13501	91 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	ERVK-9	P63128	1117 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	ERVK-24	P63145	666 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	UBXN2A	P68543	259 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	FSD1	Q9BTV5	496 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	GJD2	Q9UKL4	321 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	PARP14	Q460N5	1801 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	AAMP	Q13685	434 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	CCDC17	Q96LX7	622 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	SBK1	Q52WX2	424 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	INHA	P05111	366 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	SHISA4	Q96DD7	197 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	RNF208	Q9H0X6	261 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	PORCN	Q9H237	461 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	CNMD	O75829	334 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	ICA1	Q05084	483 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	STAP2	Q9UGK3	403 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	GNAT2	P19087	354 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470		A0A0G2JMZ2	1700 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	GJB1	P08034	283 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	PDE1A	P54750	535 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	TMX2	Q9Y320	296 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MIB2-215	ENST00000502470	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		32.45	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	MYH4	Q9Y623	1939 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	LBX2	Q6XYB7	198 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	APP	P05067	770 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	MAPK4	P31152	587 aa		32.43	■■■□□ 2.78

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