RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498439.1

CHTF18-213, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 673 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-213ENST00000498439 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.08■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.08■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.08■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.08■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.08■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.08■■□□□ 1.13
CHTF18-213ENST00000498439 JAG1P78504 1218 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 APBA2Q99767 749 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 STAP2Q9UGK3 403 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 MSCO60682 206 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 MAP2K5Q13163 448 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 MORN1Q5T089 497 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 LBX2Q6XYB7 198 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 USP6NLQ92738 828 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 RAB11FIP3O75154 756 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 RLBP1P12271 317 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 TRIM32Q13049 653 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 WDR78Q5VTH9 848 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 PLXNB2O15031 1838 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 ATP2B2Q01814 1243 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 PORCNQ9H237 461 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 SWAP70Q9UH65 585 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 STRNO43815 780 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 COG2Q14746 738 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 GPR153Q6NV75 609 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 SH2D4AQ9H788 454 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 VCAM1P19320 739 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 PTPREP23469 700 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 PLCD1P51178 756 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 GDF15Q99988 308 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-213ENST00000498439 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.126e-19■■■■■ 31.8
CHTF18-213ENST00000498439 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 PDE6AP16499 860 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 SHMT1P34896 483 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 DPP9Q86TI2 863 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 MB21D1Q8N884 522 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 GOLIM4O00461 696 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 HOXC6P09630 235 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 GABPAQ06546 454 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 PANK1Q8TE04 598 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 LPAR1Q92633 364 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 CCDC17Q96LX7 622 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 PEX10O60683 326 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 CNGA1P29973 690 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 SEPT2Q15019 361 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 CCL14Q16627 93 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 LHX8Q68G74 356 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 ACER1Q8TDN7 264 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 ALPK3Q96L96 1907 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 CNMDO75829 334 aa21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 GRB14Q14449 540 aa21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 TDHQ8IZJ6 230 aa21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 MIER1Q8N108 512 aa21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 APBB1O00213 710 aa21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 COL6A1P12109 1028 aa21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-213ENST00000498439 MROH8Q9H579 483 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms