RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 A2MP01023 1474 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 ABCA6Q8N139 1617 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 ITIH2P19823 946 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 MAPK1P28482 360 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 AOC3Q16853 763 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 VAV3Q9UKW4 847 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 REREQ9P2R6 1566 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 AGLP35573 1532 aa6.71□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
RBM39-240ENST00000495293 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 KIF3BO15066 747 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 C12orf40Q86WS4 652 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 MADDQ8WXG6 1647 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PTPRMP28827 1452 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 CELA3AP09093 270 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 KCNA1Q09470 495 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 CBX8Q9HC52 389 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ITGAEP38570 1179 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PLCB3Q01970 1234 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.346e-13■□□□□ 10.3
RBM39-240ENST00000495293 ZNF124Q15973 351 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 DAPK1P53355 1430 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 EOMESO95936 686 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 INPP5AQ14642 412 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 FAM168AQ92567 244 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ABCC5O15440 1437 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 MAPK8P45983 427 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 CDK8P49336 464 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 FBRSQ9HAH7 460 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 KIF15Q9NS87 1388 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PLXNC1O60486 1568 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PRR33A8MZF0 331 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 TRIM37O94972 964 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 GSTT1P30711 240 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ZMYM3Q14202 1370 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 KANK1Q14678 1352 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 SLITRK5O94991 958 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-240ENST00000495293 ERBINQ96RT1 1412 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-240ENST00000495293 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
RBM39-240ENST00000495293 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
RBM39-240ENST00000495293 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-240ENST00000495293 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-240ENST00000495293 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms