RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
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TOM1-216ENST00000492723 TSPY8P0CW00 308 aa19.28■□□□□ 0.68
TOM1-216ENST00000492723 SHC4Q6S5L8 630 aa19.28■□□□□ 0.68
TOM1-216ENST00000492723 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
TOM1-216ENST00000492723 COA1Q9GZY4 146 aa19.28■□□□□ 0.68
TOM1-216ENST00000492723 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa19.27■□□□□ 0.68
TOM1-216ENST00000492723 NRXN2Q9P2S2 1712 aa19.27■□□□□ 0.68
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TOM1-216ENST00000492723 USP17L4A6NCW7 530 aa19.27■□□□□ 0.68
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TOM1-216ENST00000492723 RESP18Q5W5W9 173 aa19.25■□□□□ 0.67
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TOM1-216ENST00000492723 CCDC178Q5BJE1 867 aa19.24■□□□□ 0.67
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TOM1-216ENST00000492723 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
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TOM1-216ENST00000492723 BRMS1Q9HCU9 246 aa19.24■□□□□ 0.67
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TOM1-216ENST00000492723 CEP131Q9UPN4 1083 aa19.23■□□□□ 0.67
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TOM1-216ENST00000492723 MXD3Q9BW11 206 aa19.22■□□□□ 0.67
TOM1-216ENST00000492723 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
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TOM1-216ENST00000492723 PICALMQ13492 652 aa19.21■□□□□ 0.67
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TOM1-216ENST00000492723 TRIM75PA6NK02 468 aa19.21■□□□□ 0.67
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TOM1-216ENST00000492723 TMEM47Q9BQJ4 181 aa19.21■□□□□ 0.67
TOM1-216ENST00000492723 NLRP5P59047 1200 aa19.2■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 DPCR1Q3MIW9 517 aa19.2■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 MAD2L2Q9UI95 211 aa19.2■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 SNED1Q8TER0 1413 aa19.2■□□□□ 0.66
TOM1-216ENST00000492723 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
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