RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.41■■□□□ 1.5
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NOM1-208ENST00000489850 MYH8P13535 1937 aa24.41■■□□□ 1.5
NOM1-208ENST00000489850 RAD50Q92878 1312 aa24.4■■□□□ 1.5
NOM1-208ENST00000489850 SMIM22K7EJ46 135 aa24.4■■□□□ 1.5
NOM1-208ENST00000489850 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.4■■□□□ 1.5
NOM1-208ENST00000489850 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.4■■□□□ 1.5
NOM1-208ENST00000489850 SH2D4AQ9H788 454 aa24.4■■□□□ 1.5
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NOM1-208ENST00000489850 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.39■■□□□ 1.49
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NOM1-208ENST00000489850 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.38■■□□□ 1.49
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NOM1-208ENST00000489850 C12orf42Q96LP6 360 aa24.37■■□□□ 1.49
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NOM1-208ENST00000489850 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.36■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 CYP2C8P10632 490 aa24.35■■□□□ 1.49
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NOM1-208ENST00000489850 ACER1Q8TDN7 264 aa24.35■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.35■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.35■■□□□ 1.49
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NOM1-208ENST00000489850 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.34■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 C17orf99Q6UX52 265 aa24.34■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 TNS4Q8IZW8 715 aa24.34■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.34■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 PRDM1O75626 825 aa24.33■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 KIF22Q14807 665 aa24.33■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NOM1-208ENST00000489850 LPAR1Q92633 364 aa24.33■■□□□ 1.49
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NOM1-208ENST00000489850 TSPY3P0CV98 308 aa24.32■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 TSPY8P0CW00 308 aa24.32■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.32■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 DGKZQ13574 1117 aa24.32■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 CPA4Q9UI42 421 aa24.32■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 ZNF213O14771 459 aa24.31■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 ORC4O43929 436 aa24.31■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 USP17L15C9J2P7 530 aa24.3■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 USP17L11C9JVI0 530 aa24.3■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 USP17L18D6R9N7 530 aa24.3■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 USP17L22D6RA61 530 aa24.3■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.3■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 USP17L20D6RJB6 530 aa24.3■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 BCRP11274 1271 aa24.3■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 ATP2B2Q01814 1243 aa24.3■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 USP17L24Q0WX57 530 aa24.3■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 GOPCQ9HD26 462 aa24.3■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.3■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 TSPY2A6NKD2 308 aa24.29■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.29■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.28■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 HAND2P61296 217 aa24.28■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.28■■□□□ 1.48
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NOM1-208ENST00000489850 SKAP1Q86WV1 359 aa24.28■■□□□ 1.48
NOM1-208ENST00000489850 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.28■■□□□ 1.48
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