RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa29.11■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.11■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 HOXD10P28358 340 aa29.11■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 GUCY1A2P33402 732 aa29.11■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 IFNL3Q8IZI9 196 aa29.11■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.11■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 SEPT2Q15019 361 aa29.1■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.1■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.09■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.08■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 PSMC4P43686 418 aa29.08■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.08■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 RILPL2Q969X0 211 aa29.08■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 NAPBQ9H115 298 aa29.08■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 SH2D4AQ9H788 454 aa29.08■■■□□ 2.25
EHD1-211ENST00000489379 FCGRTP55899 365 aa29.07■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa29.07■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.07■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.07■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 AKR1B1P15121 316 aa29.06■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 CAP1Q01518 475 aa29.06■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 USP17L15C9J2P7 530 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 USP17L11C9JVI0 530 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 USP17L18D6R9N7 530 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 USP17L22D6RA61 530 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 USP17L19D6RCP7 530 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 USP17L20D6RJB6 530 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 USP17L24Q0WX57 530 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 ACER1Q8TDN7 264 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 KANSL2Q9H9L4 492 aa29.05■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 HIP1O00291 1037 aa29.04■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 ICA1Q05084 483 aa29.04■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.04■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 TRIM47Q96LD4 638 aa29.04■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.04■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 SMIM22K7EJ46 135 aa29.03■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.03■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 SRRDQ9UH36 339 aa29.03■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 SDSP20132 328 aa29.02■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 HERVK_113P62684 666 aa29.02■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 PDE4BQ07343 736 aa29.02■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 ALX1Q15699 326 aa29.02■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 NBPF11Q86T75 865 aa29.02■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 LPAR1Q92633 364 aa29.02■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 TMX2Q9Y320 296 aa29.02■■■□□ 2.24
EHD1-211ENST00000489379 VCAM1P19320 739 aa29.01■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 RASA1P20936 1047 aa29.01■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.01■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa29.01■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 FAM227BQ96M60 508 aa29.01■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 DOCK3Q8IZD9 2030 aa29■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 A0A0D9SFI3 127 aa29■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 A0A1W2PRG0 241 aa29■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 CTGFP29279 349 aa29■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 PPARAQ07869 468 aa29■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 ARMC5Q96C12 935 aa29■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 MYPNQ86TC9 1320 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 PDE4AP27815 886 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 RGS19P49795 217 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 COA7Q96BR5 231 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 VCPKMTQ9H867 229 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 ZMYM6O95789 1325 aa28.97■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28.97■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 FOXP2O15409 715 aa28.97■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 LBX2Q6XYB7 198 aa28.97■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28.97■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.97■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 TTC22Q5TAA0 569 aa28.96■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 RAET1EQ8TD07 263 aa28.96■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 GOPCQ9HD26 462 aa28.96■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.96■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 NYAP2Q9P242 653 aa28.96■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.96■■■□□ 2.23
EHD1-211ENST00000489379 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa28.95■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 VPS53Q5VIR6 699 aa28.95■■■□□ 2.22
EHD1-211ENST00000489379 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms