RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 RAG1P15918 1043 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 TNNI2P48788 182 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 ARSHQ5FYA8 562 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 VPS37DQ86XT2 251 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 CAPN10Q9HC96 672 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 GINM1Q9NU53 330 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 OXCT1P55809 520 aa7.21□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 MSMPQ1L6U9 139 aa7.21□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.21□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.21□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.21□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 CDH24Q86UP0 819 aa7.21□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.2□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 ATG4CQ96DT6 458 aa7.2□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 CRBNQ96SW2 442 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 RGS13O14921 159 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 ITIH2P19823 946 aa7.19□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 SPINK2P20155 84 aa7.19□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 CCNFP41002 786 aa7.19□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.19□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 MISP3Q96FF7 219 aa7.19□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 PPT2Q9UMR5 302 aa7.19□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 PRNPP04156 253 aa7.18□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 RNF141Q8WVD5 230 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.18□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 CBX7O95931 251 aa7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 CLCN7P51798 805 aa7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 RNF4P78317 190 aa7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 TM9SF2Q99805 663 aa7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 ASPNQ9BXN1 380 aa7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.17□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 TNFRSF10CO14798 259 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTEN-204ENST00000487939 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 TINF2Q9BSI4 451 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 VAV3Q9UKW4 847 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 U3KQE9 123 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 UBOX5O94941 541 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 WNT11O96014 354 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 PRKCQQ04759 706 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-204ENST00000487939 PRR33A8MZF0 331 aa7.14□□□□□ -1.27
PTEN-204ENST00000487939 CLEC3AO75596 197 aa7.14□□□□□ -1.27
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