RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.534e-9■■■■■ 32.8
CCSAP-204ENST00000483092 TDO2P48775 406 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CXorf56Q9H5V9 222 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 L1RE1Q9UN81 338 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 AFMP43652 599 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 TC2NQ8N9U0 490 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 BCAS4Q8TDM0 211 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF3Q9H094 633 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 JAG2Q9Y219 1238 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NEDD4P46934 1319 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CMA1P23946 247 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 RASGRF1Q13972 1273 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 SHTN1A0MZ66 631 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM22K7EJ46 135 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 MAP2K7O14733 419 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 ZEB2O60315 1214 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 CDC27P30260 824 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 EHD4Q9H223 541 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 TEX33O43247 280 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 KIFC2Q96AC6 838 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0754O94854 1291 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 YEATS4O95619 227 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA5Q8NB90 893 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 CAPN7Q9Y6W3 813 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 INPP5BP32019 993 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 FCHSD1Q86WN1 690 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 RBL2Q08999 1139 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 BPIFA3Q9BQP9 254 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 ATP2B2Q01814 1243 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 FAM76AQ8TAV0 307 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 RUFY1Q96T51 708 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 STIM1Q13586 685 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 RAD9BQ6WBX8 426 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 INTS13Q9NVM9 706 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SLC5A1P13866 664 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 USP8P40818 1118 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 FILIP1LQ4L180 1135 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 FAM169AQ9Y6X4 670 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6CA6NDK9 693 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB43O43298 467 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 KCNQ2O43526 872 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 DDB1Q16531 1140 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SRGAP2O75044 1071 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 ABL1P00519 1130 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 PIP4K2BP78356 416 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.525e-7■□□□□ 11.2
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K12Q12852 859 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 GLI3P10071 1580 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 CASP14P31944 242 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 KRT40Q6A162 431 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 GBP6Q6ZN66 633 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 VPS37DQ86XT2 251 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 LPIN2Q92539 896 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 STAMQ92783 540 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 HSD3B7Q9H2F3 369 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM1O75626 825 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 GYG1P46976 350 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 APOA5Q6Q788 366 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-204ENST00000483092 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms