RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ANTXR2P58335 489 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 TRDNQ13061 729 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 PPIL2Q13356 520 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 SPRYD7Q5W111 196 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 CEP95Q96GE4 821 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 IRF6O14896 467 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 ANAPC15P60006 121 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 ICA1Q05084 483 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 PTPRFP10586 1907 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PRG0 241 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 ACER1Q8TDN7 264 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 NEK1Q96PY6 1258 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 CCDC102AQ96A19 550 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 NYAP2Q9P242 653 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-210ENST00000477812 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 ECE1P42892 770 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 SPP2Q13103 211 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 CAPNS2Q96L46 248 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TRIM75PA6NK02 468 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 CXCL11O14625 94 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 MOGSQ13724 837 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 SEC23AQ15436 765 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 IQCA1Q86XH1 822 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 ANKS1AQ92625 1134 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 MKL1Q969V6 931 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 KIF2CQ99661 725 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TTLL1O95922 423 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 MCM5P33992 734 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 MTMR2Q13614 643 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 CHST3Q7LGC8 479 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 MTA3Q9BTC8 594 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TMX2Q9Y320 296 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TNKSO95271 1327 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 PRC1O43663 620 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 CPA1P15085 419 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 BACE1P56817 501 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 DGKHQ86XP1 1220 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 ZIC5Q96T25 663 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 MYH4Q9Y623 1939 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 USP17L10C9JJH3 530 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 PSMA5P28066 241 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 VEGFBP49765 207 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 SNAPC2Q13487 334 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TTC14Q96N46 770 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 STX8Q9UNK0 236 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 RPS6KB1P23443 525 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 NOGQ13253 232 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 DGKZQ13574 1117 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 C12orf42Q96LP6 360 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-210ENST00000477812 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.46■■□□□ 1.35
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