RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477612.5

COL9A3-211, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 635 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL9A3-211ENST00000477612 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa26.05■■□□□ 1.76
COL9A3-211ENST00000477612 PARP14Q460N5 1801 aa26.04■■□□□ 1.76
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COL9A3-211ENST00000477612 LNPKQ9C0E8 428 aa26.04■■□□□ 1.76
COL9A3-211ENST00000477612 GJD2Q9UKL4 321 aa26.04■■□□□ 1.76
COL9A3-211ENST00000477612 TMX2Q9Y320 296 aa26.04■■□□□ 1.76
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COL9A3-211ENST00000477612 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.03■■□□□ 1.76
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COL9A3-211ENST00000477612 ERVK-9P63128 1117 aa26.02■■□□□ 1.76
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COL9A3-211ENST00000477612 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.02■■□□□ 1.76
COL9A3-211ENST00000477612 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.02■■□□□ 1.76
COL9A3-211ENST00000477612 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.02■■□□□ 1.76
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COL9A3-211ENST00000477612 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
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COL9A3-211ENST00000477612 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-211ENST00000477612 PEX10O60683 326 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-211ENST00000477612 CNMDO75829 334 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-211ENST00000477612 RASA1P20936 1047 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-211ENST00000477612 TDO2P48775 406 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-211ENST00000477612 UBXN2AP68543 259 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-211ENST00000477612 MTFR1Q15390 333 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-211ENST00000477612 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26■■□□□ 1.75
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