RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.62■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 KRT2P35908 639 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 SYKP43405 635 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 PLCB2Q00722 1185 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 NR5A1Q13285 461 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 SHISA4Q96DD7 197 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 KAT14Q9H8E8 782 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.61■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 TEX11Q8IYF3 940 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 FOCADQ5VW36 1801 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 TPM3P06753 285 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 RHBDL3P58872 404 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 OXER1Q8TDS5 423 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.6■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 PTPREP23469 700 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.054e-12■□□□□ 10.9
NME4-210ENST00000468031 FLT1P17948 1338 aa21.59■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 TSPY3P0CV98 308 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 TSPY8P0CW00 308 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 PLCD1P51178 756 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 SARM1Q6SZW1 724 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 MPNDQ8N594 471 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 PNMA1Q8ND90 353 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 MASTLQ96GX5 879 aa21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
NME4-210ENST00000468031 RASA1P20936 1047 aa21.58■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 CLIC6Q96NY7 704 aa21.58■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.58■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 CABP5Q9NP86 173 aa21.58■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 MMP10P09238 476 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 SCG2P13521 617 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 GNAQP50148 359 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 GTF2IP78347 998 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.57■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 MYH1P12882 1939 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 BMP15O95972 392 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 GRM4Q14833 912 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 TNFRSF25Q93038 417 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 SNED1Q8TER0 1413 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 ZNF75DP51815 510 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 NPY5RQ15761 445 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.56■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 BECN2A8MW95 431 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 CDC25BP30305 580 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 CDK8P49336 464 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 NLRP12P59046 1061 aa21.55■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 TRIM75PA6NK02 468 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 RIMBP2O15034 1052 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 TRIM5Q9C035 493 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 USP17L3A6NCW0 530 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 USP17L4A6NCW7 530 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.54■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.53■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 EYA3Q99504 573 aa21.53■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.53■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.53■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 CALML3P27482 149 aa21.52■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 TRAPPC10P48553 1259 aa21.52■■□□□ 1.04
NME4-210ENST00000468031 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.52■■□□□ 1.04
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