RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 MAPK4P31152 587 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP14P54578 494 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 ERVK-9P63128 1117 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 ERVK-24P63145 666 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 TATDN1Q6P1N9 297 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 NECAB2Q7Z6G3 386 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 ACER1Q8TDN7 264 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 SDR42E1Q8WUS8 393 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
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SH3BP1-204ENST00000459646 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.36□□□□□ -0.75
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SH3BP1-204ENST00000459646 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
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SH3BP1-204ENST00000459646 CCNA1P78396 465 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP2B2Q01814 1243 aa10.35□□□□□ -0.75
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SH3BP1-204ENST00000459646 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.35□□□□□ -0.75
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SH3BP1-204ENST00000459646 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
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SH3BP1-204ENST00000459646 PORCNQ9H237 461 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP2D6P10635 497 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 CNGA1P29973 690 aa10.34□□□□□ -0.75
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SH3BP1-204ENST00000459646 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PLS1Q14651 629 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 GPR142Q7Z601 462 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIB2Q92519 343 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 TANGO6Q9C0B7 1094 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.34□□□□□ -0.75
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SH3BP1-204ENST00000459646 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 ALPK3Q96L96 1907 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 BRCA2P51587 3418 aa10.33□□□□□ -0.76
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SH3BP1-204ENST00000459646 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 SOCS4Q8WXH5 440 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 DYNLL2Q96FJ2 89 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 NBPF3Q9H094 633 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 STAP2Q9UGK3 403 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP5JP18859 108 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP2K5Q13163 448 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 MFSD14CQ5VZR4 134 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 DPP9Q86TI2 863 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC44A5Q8NCS7 719 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf49Q9H6J7 331 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L12C9JPN9 530 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L21D6R901 530 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 SYN1P17600 705 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 ADD2P35612 726 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 COG2Q14746 738 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-204ENST00000459646 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.31□□□□□ -0.76
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