RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457647.2

RGPD4-AS1-202, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RGPD4-AS1, Length 1,792 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ELP3Q9H9T3 547 aa14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ASNSP08243 561 aa14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PTPRAP18433 802 aa14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ACER1Q8TDN7 264 aa14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CABP5Q9NP86 173 aa14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.88□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TNKSO95271 1327 aa14.87□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HUNKP57058 714 aa14.87□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FKBP1BP68106 108 aa14.87□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ATP2B2Q01814 1243 aa14.87□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ICA1Q05084 483 aa14.87□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SEC23AQ15436 765 aa14.87□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PICK1Q9NRD5 415 aa14.87□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.87□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CSADQ9Y600 493 aa14.87□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 A0A1W2PRG0 241 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GJA5P36382 358 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ECE1P42892 770 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 NEK4P51957 841 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 Q6ZUG5 572 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IQCA1Q86XH1 822 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TTC14Q96N46 770 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 LY9Q9HBG7 655 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 STX8Q9UNK0 236 aa14.86□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DGKZQ13574 1117 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 USP17L5A8MUK1 530 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 NOVP48745 357 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 OPTNQ96CV9 577 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 OTUD5Q96G74 571 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.85□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TTLL1O95922 423 aa14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HTRA3P83110 453 aa14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RABEP1Q15276 862 aa14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TMEM87BQ96K49 555 aa14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.84□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TRIM75PA6NK02 468 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 AK2P54819 239 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SPP2Q13103 211 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 WTAPQ15007 396 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ANKS1AQ92625 1134 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BRF1Q92994 677 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GINM1Q9NU53 330 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 NYAP2Q9P242 653 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MTMR7Q9Y216 660 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.83□□□□□ -0.03
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IRF6O14896 467 aa14.83□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 NT5C2P49902 561 aa14.83□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 APLP1P51693 650 aa14.83□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 APOBRQ0VD83 1088 aa14.83□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ERO1BQ86YB8 467 aa14.83□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.83□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MYL10Q9BUA6 226 aa14.83□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FGD1P98174 961 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MTMR2Q13614 643 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DGKHQ86XP1 1220 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 WNK4Q96J92 1243 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 WDR18Q9BV38 432 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ERICH2A1L162 156 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RXRAP19793 462 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 LIFRP42702 1097 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms