RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 TRIML1Q8N9V2 468 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 MLKLQ8NB16 471 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TNFRSF25Q93038 417 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 NLRP3Q96P20 1036 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM232C9JQI7 657 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 KANK3Q6NY19 840 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 SMARCE1Q969G3 411 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 NYXQ9GZU5 481 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.32■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 WNT7AO00755 349 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF18P17022 549 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 PRDX5P30044 214 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 KIF18AQ8NI77 898 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 MED15Q96RN5 788 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 MYH6P13533 1939 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 A0A087X0B3 334 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 NRDCO43847 1150 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 RPS6KA4O75676 772 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF827Q17R98 1081 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 SETDB2Q96T68 719 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.31■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 NMT2O60551 498 aa18.3■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 IRS2Q9Y4H2 1338 aa18.3■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 EPSTI1Q96J88 318 aa18.3■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 DACH1Q9UI36 760 aa18.3■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa18.3■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TM4SF1P30408 202 aa18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 SBK1Q52WX2 424 aa18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ZBTB22O15209 634 aa18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TOP1P11387 765 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 PTPN21Q16825 1174 aa18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.29■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 CYP2D6P10635 497 aa18.28■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.28■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 BMP15O95972 392 aa18.28■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM139Q8IV31 216 aa18.28■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 FERMT2Q96AC1 680 aa18.28■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 DHX58Q96C10 678 aa18.28■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 SLFN14P0C7P3 912 aa18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 L2HGDHQ9H9P8 463 aa18.27■□□□□ 0.52
SHQ1-202ENST00000444040 TUBB4AP04350 444 aa18.27■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 PLCD1P51178 756 aa18.27■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.27■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.27■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 RCSD1Q6JBY9 416 aa18.27■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 LAMB1P07942 1786 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF174Q15697 407 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 TTC38Q5R3I4 469 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 AMIGO3Q86WK7 504 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 PAGE5Q96GU1 130 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 GNPATO15228 680 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 ZPR1O75312 459 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 ERO1AQ96HE7 468 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 SCG2P13521 617 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 VPS72Q15906 364 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 MAST2Q6P0Q8 1798 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 CCP110O43303 1012 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC93Q567U6 631 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 JAG2Q9Y219 1238 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 AFMP43652 599 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 DPYDQ12882 1025 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-202ENST00000444040 PTGDRQ13258 359 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms