RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 IFNAR1P17181 557 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 KRT23Q9C075 422 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 SRGAP2O75044 1071 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 PNKPQ96T60 521 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 PSMB7Q99436 277 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 PLCD1P51178 756 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 NLRP5P59047 1200 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 ATG3Q9NT62 314 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 MRC1P22897 1456 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 CAPN2P17655 700 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 XBP1P17861 261 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 PTGDRQ13258 359 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 LPIN2Q92539 896 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 GDAQ9Y2T3 454 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-202ENST00000440289 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM66O15016 1216 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 MORC3Q14149 939 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ZSCAN26Q16670 478 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 PAGE5Q96GU1 130 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCB6Q9NP58 842 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 KRT9P35527 623 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 UBXN1Q04323 297 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 PPARAQ07869 468 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 DPYDQ12882 1025 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 TAF3Q5VWG9 929 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 BTG4Q9NY30 223 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 LAMA4Q16363 1823 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CTAGE9A4FU28 777 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 UIMC1Q96RL1 719 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 KRT2P35908 639 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 TXLNAP40222 546 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CUL4BQ13620 913 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 KIFC2Q96AC6 838 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CHP1Q99653 195 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 KIF1AQ12756 1690 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CSF1RP07333 972 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CAGE1Q8TC20 777 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 PP2D1A8MPX8 630 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 NR1I3Q14994 352 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM170AA1A519 330 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 PDE8AO60658 829 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF18P17022 549 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 VSNL1P62760 191 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 AK7Q96M32 723 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 FUT8Q9BYC5 575 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 EP400Q96L91 3159 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 LIFRP42702 1097 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA1Q5VX52 437 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ESR2Q92731 530 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM51Q9NW97 253 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 ADAMTS3O15072 1205 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 GYPCP04921 128 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CTAGE8P0CG41 777 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-202ENST00000440289 TTC38Q5R3I4 469 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms