RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPA1P15085 419 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCM5P33992 734 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLCN1P35523 988 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 MMP14P50281 582 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC24Q50LG9 513 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZUG5 572 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB123Q8N688 67 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 RGS22Q8NE09 1264 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 BRI3BPQ8WY22 251 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 XAGE2Q96GT9 111 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZMYM6O95789 1325 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 PFKFB2O60825 505 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDKL5O76039 1030 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 GJA8P48165 433 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 TIMM10P62072 90 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR153Q6NV75 609 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q7L0L9 218 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXL16Q8N461 479 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 NCOA7Q8NI08 942 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 OPTNQ96CV9 577 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPATA32Q96LK8 384 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELP3Q9H9T3 547 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYH2Q9UKX2 1941 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 E7EWF7 191 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDE8BO95263 885 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CAVIN2O95810 425 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 GJB1P08034 283 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC192P0DO97 292 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE3CQ15386 1083 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 NECAB1Q8N987 351 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 LPIN2Q92539 896 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 BRF1Q92994 677 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 COA1Q9GZY4 146 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF213O14771 459 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPLX1O14810 134 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNRH1P01148 92 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCL5P13501 91 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNAT2P19087 354 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRMT2P55345 433 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP3K12Q12852 859 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 STK3Q13188 491 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIF22Q14807 665 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 DLGAP5Q15398 846 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCL15Q16663 113 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 GREM2Q9H772 168 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P1-201ENST00000437111 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms