RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PQ64 194 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PQD8 194 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 RASA1P20936 1047 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 ANO6Q4KMQ2 910 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 MTMR7Q9Y216 660 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 PTPAQ15257 358 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL34Q8N239 644 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 CDK8P49336 464 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 UVSSAQ2YD98 709 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 PNMA1Q8ND90 353 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 STX8Q9UNK0 236 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 SLX4Q8IY92 1834 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 PLCB2Q00722 1185 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 DGKHQ86XP1 1220 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 EYA3Q99504 573 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 MYH1P12882 1939 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-209ENST00000428120 ATP2B1P20020 1258 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 STYK1Q6J9G0 422 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 CLIC6Q96NY7 704 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 A0A087WWV3 80 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 XBP1P17861 261 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 FAM205CA6NFA0 338 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 LUZP1Q86V48 1076 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 CABP5Q9NP86 173 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 SNED1Q8TER0 1413 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 PFKFB1P16118 471 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 SDF4Q9BRK5 362 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 CTAGE5O15320 804 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 PPP6R2O75170 966 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 CMA1P23946 247 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 KIF5BP33176 963 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 ESPNB1AK53 854 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 JMYQ8N9B5 988 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 USP40Q9NVE5 1235 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 ADCY5O95622 1261 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 SHC4Q6S5L8 630 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 ANKS1AQ92625 1134 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 CBX8Q9HC52 389 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 AP5Z1O43299 807 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 PODNQ7Z5L7 613 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF202O95125 648 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 KRT2P35908 639 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-209ENST00000428120 CNKSR1Q969H4 720 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 FOCADQ5VW36 1801 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 SCG2P13521 617 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 NT5C2P49902 561 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 TEKT1Q969V4 418 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 ECE2O60344 883 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 AOC3Q16853 763 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 SPECC1Q5M775 1068 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 SCN9AQ15858 1988 aa26.69■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF165P49910 485 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 GRM4Q14833 912 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 NPY5RQ15761 445 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 GRIN1Q05586 938 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 CEP95Q96GE4 821 aa26.68■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
FAAP20-209ENST00000428120 CRKP46108 304 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms