RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS53Q5VIR6 699 aa29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 TICAM2Q86XR7 235 aa29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC17Q96LX7 622 aa29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 EFCC1Q9HA90 598 aa29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 OSBPP22059 807 aa29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 PNMA3Q9UL41 463 aa29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 FOXP2O15409 715 aa29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF22Q14807 665 aa29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC22Q5TAA0 569 aa29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PRG0 241 aa29.82■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.82■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 PRDM1O75626 825 aa29.82■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 BCRP11274 1271 aa29.82■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.82■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.82■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 RASA1P20936 1047 aa29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 USP14P54578 494 aa29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 PPARAQ07869 468 aa29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF6Q15052 776 aa29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP2B2Q01814 1243 aa29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ICA1Q05084 483 aa29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 CTGFP29279 349 aa29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 PSMC4P43686 418 aa29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.79■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 C12orf42Q96LP6 360 aa29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.78■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 HIP1O00291 1037 aa29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 NEFLP07196 543 aa29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 KANSL2Q9H9L4 492 aa29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.77■■■□□ 2.36
HTATSF1-202ENST00000425695 FGAP02671 866 aa29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 EEF2P13639 858 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 VCAM1P19320 739 aa29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE4BQ07343 736 aa29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 ALX1Q15699 326 aa29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM47Q96LD4 638 aa29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 INCENPQ9NQS7 918 aa29.76■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L15C9J2P7 530 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L11C9JVI0 530 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L18D6R9N7 530 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L22D6RA61 530 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L19D6RCP7 530 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L20D6RJB6 530 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L24Q0WX57 530 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 SKAP1Q86WV1 359 aa29.75■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 PEX10O60683 326 aa29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 HERVK_113P62684 666 aa29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 TMX2Q9Y320 296 aa29.74■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.73■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.73■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 SH2D4AQ9H788 454 aa29.73■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 FCGRTP55899 365 aa29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.72■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD21O60216 631 aa29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 TFAP4Q01664 338 aa29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 VCPKMTQ9H867 229 aa29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.71■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 GNRH1P01148 92 aa29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPY3P0CV98 308 aa29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPY8P0CW00 308 aa29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 HAND2P61296 217 aa29.7■■■□□ 2.35
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