RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421164.5

AFG3L1P-204, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AFG3L1P, Length 1,706 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-204ENST00000421164 VGLL4Q14135 290 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 BRF1Q92994 677 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 TMEM87BQ96K49 555 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ASNSP08243 561 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 FBXL16Q8N461 479 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 STX8Q9UNK0 236 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 MYH8P13535 1937 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 APOBRQ0VD83 1088 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 WTAPQ15007 396 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ACER1Q8TDN7 264 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ANKS1AQ92625 1134 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 MTA3Q9BTC8 594 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 A0A1W2PRG0 241 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 PTPRAP18433 802 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 LIFRP42702 1097 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 FGD1P98174 961 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ATP2B2Q01814 1243 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ICA1Q05084 483 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 DGKHQ86XP1 1220 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.47■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ERICH2A1L162 156 aa20.46■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 TTLL1O95922 423 aa20.46■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ECE1P42892 770 aa20.46■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.46■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.46■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ELP3Q9H9T3 547 aa20.46■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 NYAP2Q9P242 653 aa20.46■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.46■□□□□ 0.87
AFG3L1P-204ENST00000421164 ST18O60284 1047 aa20.45■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.45■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.45■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 PICK1Q9NRD5 415 aa20.45■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.45■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 CSADQ9Y600 493 aa20.45■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 USP17L5A8MUK1 530 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 FKBP1BP68106 108 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 MYL10Q9BUA6 226 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 GINM1Q9NU53 330 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 LARGE1O95461 756 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 FSTL1Q12841 308 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 MKL1Q969V6 931 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 OTOFQ9HC10 1997 aa20.44■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.43■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 EVCP57679 992 aa20.43■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 TMTC2Q8N394 836 aa20.43■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 CCDC69A6NI79 296 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 RXRAP19793 462 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 ANKRD1Q15327 319 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 APOA5Q6Q788 366 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 PNMA1Q8ND90 353 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 KAT14Q9H8E8 782 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 MTMR7Q9Y216 660 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 DOCK1Q14185 1865 aa20.42■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 SPP2Q13103 211 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 DGKZQ13574 1117 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 ME3Q16798 604 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 SNX21Q969T3 373 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 TMX2Q9Y320 296 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 GJA5P36382 358 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 HUNKP57058 714 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 TROAPQ12815 778 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 WDR18Q9BV38 432 aa20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
AFG3L1P-204ENST00000421164 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms