RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 STX8Q9UNK0 236 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTLL1O95922 423 aa19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 GH2P01242 217 aa19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASNSP08243 561 aa19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ME3Q16798 604 aa19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOA5Q6Q788 366 aa19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CATIPQ7Z7H3 387 aa19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 KAT14Q9H8E8 782 aa19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 SENP2Q9HC62 589 aa19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIPA1L1O43166 1804 aa19.84■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CALM1P0DP23 149 aa19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CALM2P0DP24 149 aa19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CALM3P0DP25 149 aa19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOP1P11387 765 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 NYAP2Q9P242 653 aa19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSC5DA1L4H1 1573 aa19.83■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA8BA8MQT2 603 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB43O43298 467 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 PFKFB2O60825 505 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDAH1O94760 285 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 GUCY1A2P33402 732 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 CUL4AQ13619 759 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEPT2Q15019 361 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB3GAP1Q15042 981 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF654Q8IZM8 581 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLRG1Q96E93 195 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 WRNIP1Q96S55 665 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM47Q9BQJ4 181 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 LARGE1O95461 756 aa19.82■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 JAG1P78504 1218 aa19.82■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ICA1Q05084 483 aa19.82■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP2R5BQ15173 497 aa19.82■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNMA1Q8ND90 353 aa19.82■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.82■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP2O75604 605 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCYL3Q8IZE3 742 aa19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTF3C6Q969F1 213 aa19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 MKL1Q969V6 931 aa19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K14Q99558 947 aa19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 HPS5Q9UPZ3 1129 aa19.81■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 NID2Q14112 1375 aa19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 EEF2P13639 858 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 IREB2P48200 963 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 TROAPQ12815 778 aa19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 STK3Q13188 491 aa19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHADLQ6NUI6 762 aa19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLK2Q6UY11 383 aa19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 MICU3Q86XE3 530 aa19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa19.79■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA8AA7E2F4 631 aa19.79■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 INPP5BP32019 993 aa19.79■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCRN1Q12765 414 aa19.79■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K11Q16584 847 aa19.79■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 NECAB1Q8N987 351 aa19.79■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa19.79■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 PICK1Q9NRD5 415 aa19.79■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF5BP33176 963 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K9P80192 1104 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP2B2Q01814 1243 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARMC9Q7Z3E5 817 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC10AQ8IUN9 316 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIAH1Q8IUQ4 282 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC83Q8IWF9 413 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 FANCBQ8NB91 859 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUP133Q8WUM0 1156 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYL10Q9BUA6 226 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SH2D4AQ9H788 454 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNCXA6NJT0 531 aa19.77■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L5A8MUK1 530 aa19.77■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC4A3P48751 1232 aa19.77■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 FKBP1BP68106 108 aa19.77■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCT2P78371 535 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRKG1Q13976 671 aa19.77■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTN1Q16799 776 aa19.77■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAF5O00463 557 aa19.76■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ST3GAL1Q11201 340 aa19.76■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms