RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.28□□□□□ -1.4
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.28□□□□□ -1.4
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLIT2O94813 1529 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXP2O15409 715 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FIBPO43427 364 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AP1G2O75843 785 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CAMTA2O94983 1202 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MCAMP43121 646 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP3K12Q12852 859 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDB1Q16531 1140 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HLFQ16534 295 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC102BQ68D86 513 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADALQ6DHV7 355 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q8N3U1 123 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GREM2Q9H772 168 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.27□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STK36Q9NRP7 1315 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 M0R2C6 588 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPAA1O43292 621 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYO1BO43795 1136 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NEMFO60524 1076 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CTDNEP1O95476 244 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDC25BP30305 580 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZAP70P43403 619 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SIK1P57059 783 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBE4AQ14139 1066 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WASHC4Q2M389 1173 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SARM1Q6SZW1 724 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SV2AQ7L0J3 742 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WASF1Q92558 559 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRT23Q9C075 422 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TNMDQ9H2S6 317 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ITGB4P16144 1822 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.26□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPINT1O43278 529 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRC1O43663 620 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NTSR2O95665 410 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDE6AP16499 860 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADORA1P30542 326 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TYRO3Q06418 890 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GAS6Q14393 721 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CERS3Q8IU89 383 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 JMYQ8N9B5 988 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPATA5Q8NB90 893 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BANK1Q8NDB2 785 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms