RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413606.5

CCDC18-AS1-202, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 770 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 AKR1B1P15121 316 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SLC4A3P48751 1232 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.819e-6■□□□□ 8.1
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 RCSD1Q6JBY9 416 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ZNF654Q8IZM8 581 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CEP95Q96GE4 821 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 KIF3AQ9Y496 699 aa10□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CPLX1O14810 134 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 LARGE1O95461 756 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ASNSP08243 561 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 KIF5BP33176 963 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 TROAPQ12815 778 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 MICU3Q86XE3 530 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 PNMA1Q8ND90 353 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NYAP2Q9P242 653 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 FAM196BA6NMK8 535 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 POTECB2RU33 542 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NMT2O60551 498 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GH2P01242 217 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 PDCP20941 246 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NF2P35240 595 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CAP2P40123 477 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GNAQP50148 359 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ICA1Q05084 483 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SCRN1Q12765 414 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 STK3Q13188 491 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 RTN1Q16799 776 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 USP48Q86UV5 1035 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NECAB1Q8N987 351 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 FANCBQ8NB91 859 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 MKL1Q969V6 931 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SH2D4AQ9H788 454 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SENP2Q9HC62 589 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 IFNAR1P17181 557 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ST3GAL1Q11201 340 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 LDHDQ86WU2 507 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 RGS22Q8NE09 1264 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GDF11O95390 407 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 DDIT3P35638 169 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NUCB2P80303 420 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GRM4Q14833 912 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SEPT2Q15019 361 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 STK36Q9NRP7 1315 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 UNCXA6NJT0 531 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ADM5C9JUS6 153 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SLURP2P0DP57 97 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SNHG28P0DPA3 235 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 SMARCA1P28370 1054 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GJB2P29033 226 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 GUCY1A2P33402 732 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC18-AS1-202ENST00000413606 ATP2B2Q01814 1243 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms