RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411827.1

CDC42-204, Transcript of cell division cycle 42, humanhuman

TSL 3

Gene CDC42, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-204ENST00000411827 SEC23AQ15436 765 aa21.89■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.89■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.89■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 SNX21Q969T3 373 aa21.89■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 MKL1Q969V6 931 aa21.89■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.89■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 USP17L5A8MUK1 530 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 TRAF5O00463 557 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CALM1P0DP23 149 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CALM2P0DP24 149 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CALM3P0DP25 149 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 HSPA6P17066 643 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ICA1Q05084 483 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 PPP2R5BQ15173 497 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 Q6ZUG5 572 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CEP95Q96GE4 821 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.88■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 PASKQ96RG2 1323 aa21.87■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CCDC69A6NI79 296 aa21.87■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 GDF11O95390 407 aa21.87■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.87■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 WDR18Q9BV38 432 aa21.87■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 KAT14Q9H8E8 782 aa21.87■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 LY9Q9HBG7 655 aa21.87■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 STX8Q9UNK0 236 aa21.87■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.87■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 INPP5BP32019 993 aa21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 SEPT2Q15019 361 aa21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CHST3Q7LGC8 479 aa21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 MAP3K14Q99558 947 aa21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.86■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CPA1P15085 419 aa21.85■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 PTPRAP18433 802 aa21.85■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 VGLL4Q14135 290 aa21.85■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ERO1BQ86YB8 467 aa21.85■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 BRF1Q92994 677 aa21.85■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.85■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.85■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 DDAH1O94760 285 aa21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 SLURP2P0DP57 97 aa21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 GUCY1A2P33402 732 aa21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 AK2P54819 239 aa21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 PPATQ06203 517 aa21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 PRKG1Q13976 671 aa21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 BECN1Q14457 450 aa21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.84■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 C19orf81C9J6K1 198 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 USP14P54578 494 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 DLK2Q6UY11 383 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 GOPCQ9HD26 462 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 TMX2Q9Y320 296 aa21.83■■□□□ 1.09
CDC42-204ENST00000411827 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 NMT2O60551 498 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 KIF5BP33176 963 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 CST9Q5W186 159 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 APOA5Q6Q788 366 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 HSCBQ8IWL3 235 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 PNMA1Q8ND90 353 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 LPAR1Q92633 364 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.82■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 DOCK1Q14185 1865 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 CXCL11O14625 94 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 ZBTB43O43298 467 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 JAG1P78504 1218 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.81■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.8■■□□□ 1.08
CDC42-204ENST00000411827 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms