RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399469.2

HIVEP1-202, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HIVEP1, Length 2,085 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-202ENST00000399469 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 TFAP4Q01664 338 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 EVX2Q03828 476 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 SCRN1Q12765 414 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 IRF5Q13568 498 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 SEC23AQ15436 765 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 DGKHQ86XP1 1220 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 VEZTQ9HBM0 779 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
HIVEP1-202ENST00000399469 MYH4Q9Y623 1939 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CPLX1O14810 134 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CDKL5O76039 1030 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 PDCP20941 246 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 MICU3Q86XE3 530 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 SGSM3Q96HU1 749 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CCDC17Q96LX7 622 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CSRNP1Q96S65 589 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 SCN4AP35499 1836 aa8.71□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 DDAH1O94760 285 aa8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 SHMT1P34896 483 aa8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 ST3GAL1Q11201 340 aa8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.7□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CNTNAP1P78357 1384 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 GJB2P29033 226 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 ANKS1AQ92625 1134 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 KAT14Q9H8E8 782 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 SHTN1A0MZ66 631 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 RTN1Q16799 776 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 SENP2Q9HC62 589 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 WDR70Q9NW82 654 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 STX8Q9UNK0 236 aa8.69□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 UTRNP46939 3433 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 NMT2O60551 498 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 KIF5BP33176 963 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 FANCBQ8NB91 859 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 HOOK2Q96ED9 719 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 MAP3K14Q99558 947 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 HACL1Q9UJ83 578 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D12O60347 775 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 EGFRP00533 1210 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 AKR1B1P15121 316 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 TROAPQ12815 778 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 PNMA1Q8ND90 353 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 CEP95Q96GE4 821 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 DNAJC18Q9H819 358 aa8.68□□□□□ -1.02
HIVEP1-202ENST00000399469 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms