RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391218.1

RNU6-1250P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1250, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1250P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CEP135Q66GS9 1140 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PPP2R2DQ66LE6 453 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FBXO42Q6P3S6 717 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TUBA3EQ6PEY2 450 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HDXQ7Z353 690 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMC6Q7Z403 805 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SAPCD2Q86UD0 394 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 VRK3Q8IV63 474 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ULK2Q8IYT8 1036 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IL17DQ8TAD2 202 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SPIRE2Q8WWL2 714 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 L3MBTL2Q969R5 705 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IFT43Q96FT9 208 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CCDC120Q96HB5 630 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ARXQ96QS3 562 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZBTB3Q9H5J0 574 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SYNPO2LQ9H987 977 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LIMD1Q9UGP4 676 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PRO0461Q9UI25 63 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FKBPLQ9UIM3 349 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 COX11Q9Y6N1 276 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HIVEP2P31629 2446 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SH3D21A4FU49 640 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ANTXRLA6NF34 631 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMEM191CA6NGB0 347 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GNAT3A8MTJ3 354 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 WASH4PA8MWX3 477 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PRR33A8MZF0 331 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PRSS44E7EML9 344 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 H3BRJ5 948 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 EML1O00423 815 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GRID2O43424 1007 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TADA3O75528 432 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZGLP1P0C6A0 271 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SNHG28P0DPA3 235 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ACRP10323 421 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CCKARP32238 428 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CXCR3P49682 368 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CCT4P50991 539 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PIP4K2BP78356 416 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CAP1Q01518 475 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GRM2Q14416 872 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HIC1Q14526 733 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RGL3Q3MIN7 710 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TBCELQ5QJ74 424 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OLFML1Q6UWY5 402 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FAM214BQ7L5A3 538 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 BTLAQ7Z6A9 289 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF329Q86UD4 541 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C1orf210Q8IVY1 113 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HS6ST3Q8IZP7 471 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LILRA2Q8N149 483 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NLGN1Q8N2Q7 840 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MTMR14Q8NCE2 650 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ACRBPQ8NEB7 543 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ANKS1AQ92625 1134 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 UBE2FQ969M7 185 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF524Q96C55 264 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SUSD3Q96L08 255 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GNRHR2Q96P88 292 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FCRL4Q96PJ5 515 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RBSNQ9H1K0 784 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SEMA4AQ9H3S1 761 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 JADE2Q9NQC1 790 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZSWIM5Q9P217 1185 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LRFN2Q9ULH4 789 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF232Q9UNY5 417 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ICKQ9UPZ9 632 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 A0A087WYN8 130 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MROH6A6NGR9 719 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IFITM10A6NMD0 228 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NOTOA8MTQ0 251 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HRKO00198 91 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF185O15231 689 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TP73O15350 636 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FOXS1O43638 330 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms