RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ERC2O15083 957 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 LMAN1P49257 510 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 COX10Q12887 443 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 WTAPQ15007 396 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 USP54Q70EL1 1684 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC72A6NJI9 287 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP8B1O43520 1251 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF804AQ7Z570 1209 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 IQCA1Q86XH1 822 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM50Q86XT4 487 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 APPBP2Q92624 585 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 ESX1Q8N693 406 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 FRS2Q8WU20 508 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GUA9 196 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 LIG3P49916 1009 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP2R5CQ13362 524 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CUL4BQ13620 913 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 F8W031 263 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CENPAP49450 140 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM25EA8MYX2 175 aa7.69□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 JDP2Q8WYK2 163 aa7.69□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 P4HA2O15460 535 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GZMAP12544 262 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ARPC4P59998 168 aa7.68□□□□□ -1.18
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