RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 BCRP11274 1271 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 SDSP20132 328 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 CTGFP29279 349 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 FEZ1Q99689 392 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1W2PRG0 241 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 TTC22Q5TAA0 569 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L2Q6R6M4 530 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 C12orf42Q96LP6 360 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 NAPBQ9H115 298 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-202ENST00000370287 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 RASA1P20936 1047 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 TICAM2Q86XR7 235 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC17Q96LX7 622 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 NACAP1Q9BZK3 213 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 EFCC1Q9HA90 598 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 PNMA3Q9UL41 463 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 HTTP42858 3142 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC171Q6TFL3 1326 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 PRDM1O75626 825 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 ICA1Q05084 483 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 PPARAQ07869 468 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 SIAH1Q8IUQ4 282 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 VCAM1P19320 739 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 OSBPP22059 807 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 SKAP1Q86WV1 359 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 TACC3Q9Y6A5 838 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 PEX10O60683 326 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP14P54578 494 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 CTDSPL2Q05D32 466 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 TRIM47Q96LD4 638 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 IL25Q9H293 177 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 MKNK2Q9HBH9 465 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 PTPN22Q9Y2R2 807 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC85CA6NKD9 419 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 PSMC4P43686 418 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 KIF22Q14807 665 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 ALX1Q15699 326 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 INCENPQ9NQS7 918 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 FGAP02671 866 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 HERVK_113P62684 666 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 FAM110CQ1W6H9 321 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 TMX2Q9Y320 296 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L15C9J2P7 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L13C9JLJ4 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L11C9JVI0 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L18D6R9N7 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L22D6RA61 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L17D6RBQ6 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L19D6RCP7 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L20D6RJB6 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 HIP1O00291 1037 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 ATP2B2Q01814 1243 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 USP17L24Q0WX57 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 VCPKMTQ9H867 229 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 ANAPC4Q9UJX5 808 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-202ENST00000370287 MGAMO43451 1857 aa17.77■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 ZMYM6O95789 1325 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 PDE4BQ07343 736 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGEF6Q15052 776 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 FAM47AQ5JRC9 791 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 SPICE1Q8N0Z3 855 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 PLIN4Q96Q06 1357 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-202ENST00000370287 FCGRTP55899 365 aa17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms