RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 OPA1O60313 960 aa24.48■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 PHKBQ93100 1093 aa24.48■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 SMTNP53814 917 aa24.48■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 PDCLQ13371 301 aa24.48■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 JAKMIP2Q96AA8 810 aa24.48■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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OPN3-201ENST00000366554 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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OPN3-201ENST00000366554 KRT9P35527 623 aa24.47■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 TTMPQ5BVD1 217 aa24.47■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.47■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 MST1RQ04912 1400 aa24.47■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
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OPN3-201ENST00000366554 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 ARL8AQ96BM9 186 aa24.47■■□□□ 1.51
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OPN3-201ENST00000366554 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.46■■□□□ 1.51
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OPN3-201ENST00000366554 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.46■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 MYD88Q99836 296 aa24.46■■□□□ 1.51
OPN3-201ENST00000366554 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
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OPN3-201ENST00000366554 KRT31Q15323 416 aa24.45■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
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OPN3-201ENST00000366554 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.45■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 TRIM29Q14134 588 aa24.45■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 NTRK3Q16288 839 aa24.45■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.45■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 USP49Q70CQ1 688 aa24.45■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.45■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.44■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 N4BP3O15049 544 aa24.44■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 HERVK_113P62684 666 aa24.44■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 PLCB4Q15147 1175 aa24.44■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.44■■□□□ 1.5
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OPN3-201ENST00000366554 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.44■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 ZNF185O15231 689 aa24.44■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 RXRAP19793 462 aa24.44■■□□□ 1.5
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OPN3-201ENST00000366554 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.43■■□□□ 1.5
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OPN3-201ENST00000366554 NAA35Q5VZE5 725 aa24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 ALS2CLQ60I27 953 aa24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 TFR2Q9UP52 801 aa24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 A1BGP04217 495 aa24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 PPP2R5AQ15172 486 aa24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 RUBCNQ92622 972 aa24.43■■□□□ 1.5
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OPN3-201ENST00000366554 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.43■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 C2orf54Q08AI8 447 aa24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 CAGE1Q8TC20 777 aa24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 EPN3Q9H201 632 aa24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 IQCA1Q86XH1 822 aa24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 CCDC13Q8IYE1 715 aa24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 HINFPQ9BQA5 517 aa24.42■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 BTBD18B2RXH4 712 aa24.41■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.41■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 LSP1P33241 339 aa24.41■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 APOA5Q6Q788 366 aa24.41■■□□□ 1.5
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OPN3-201ENST00000366554 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
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OPN3-201ENST00000366554 GPR108Q9NPR9 543 aa24.41■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.41■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.41■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 DPYDQ12882 1025 aa24.4■■□□□ 1.5
OPN3-201ENST00000366554 EMC10Q5UCC4 262 aa24.4■■□□□ 1.5
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