RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 FEZ1Q99689 392 aa32.24■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 NACAP1Q9BZK3 213 aa32.24■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa32.24■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 C19orf81C9J6K1 198 aa32.23■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 RASA1P20936 1047 aa32.23■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 TICAM2Q86XR7 235 aa32.23■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 SIAH1Q8IUQ4 282 aa32.23■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 TMOD4Q9NZQ9 345 aa32.23■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM17Q9Y577 477 aa32.23■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 BCRP11274 1271 aa32.22■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 CTGFP29279 349 aa32.22■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 OTOP1Q7RTM1 612 aa32.22■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC17Q96LX7 622 aa32.22■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP32.22■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa32.22■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC171Q6TFL3 1326 aa32.22■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 PRDM1O75626 825 aa32.21■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 PPARAQ07869 468 aa32.21■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L2Q6R6M4 530 aa32.21■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 IFFO2Q5TF58 517 aa32.2■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf42Q96LP6 360 aa32.2■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 IL25Q9H293 177 aa32.2■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa32.2■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 CAPN15O75808 1086 aa32.19■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 TACC3Q9Y6A5 838 aa32.19■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 ICA1Q05084 483 aa32.18■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 MKNK2Q9HBH9 465 aa32.18■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa32.18■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 CTDSPL2Q05D32 466 aa32.17■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa32.17■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 INCENPQ9NQS7 918 aa32.17■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 PNMA3Q9UL41 463 aa32.17■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 VCAM1P19320 739 aa32.16■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 OSBPP22059 807 aa32.16■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 EFCC1Q9HA90 598 aa32.16■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 PEX10O60683 326 aa32.15■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 FGAP02671 866 aa32.15■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP32.15■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 ALX1Q15699 326 aa32.15■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa32.15■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 EEF2P13639 858 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 USP14P54578 494 aa32.14■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 POTEEQ6S8J3 1075 aa32.14■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP32.14■■■□□ 2.74
TPGS1-201ENST00000359315 HIP1O00291 1037 aa32.13■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM47Q96LD4 638 aa32.13■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 HPS5Q9UPZ3 1129 aa32.13■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 ATP2B2Q01814 1243 aa32.12■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC136Q96JN2 1154 aa32.12■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 TMX2Q9Y320 296 aa32.12■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 NEFLP07196 543 aa32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 PSMC4P43686 418 aa32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 HERVK_113P62684 666 aa32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 FAM47AQ5JRC9 791 aa32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 KANSL2Q9H9L4 492 aa32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 ANAPC4Q9UJX5 808 aa32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 PTPN22Q9Y2R2 807 aa32.11■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 HAND2P61296 217 aa32.1■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 SPICE1Q8N0Z3 855 aa32.1■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF3Q9H094 633 aa32.1■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 TXNRD2Q9NNW7 524 aa32.1■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZMYM6O95789 1325 aa32.09■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 PDE4BQ07343 736 aa32.09■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 KIF22Q14807 665 aa32.09■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 FAM110CQ1W6H9 321 aa32.09■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 MYH8P13535 1937 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L15C9J2P7 530 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L13C9JLJ4 530 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L11C9JVI0 530 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L18D6R9N7 530 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L22D6RA61 530 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L17D6RBQ6 530 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L19D6RCP7 530 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L20D6RJB6 530 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 CHMLP26374 656 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L24Q0WX57 530 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 VCPKMTQ9H867 229 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF287Q9HBT7 754 aa32.08■■■□□ 2.73
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC85CA6NKD9 419 aa32.07■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
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