RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.39■■□□□ 1.02
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SNX11-201ENST00000359238 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
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SNX11-201ENST00000359238 RTN1Q16799 776 aa21.33■■□□□ 1.01
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SNX11-201ENST00000359238 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.33■■□□□ 1.01
SNX11-201ENST00000359238 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.33■■□□□ 1.01
SNX11-201ENST00000359238 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
SNX11-201ENST00000359238 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SNX11-201ENST00000359238 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.33■■□□□ 1
SNX11-201ENST00000359238 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.33■■□□□ 1
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SNX11-201ENST00000359238 FOCADQ5VW36 1801 aa21.32■■□□□ 1
SNX11-201ENST00000359238 GAKO14976 1311 aa21.32■■□□□ 1
SNX11-201ENST00000359238 FLT1P17948 1338 aa21.32■■□□□ 1
SNX11-201ENST00000359238 PPIP5K2O43314 1243 aa21.32■■□□□ 1
SNX11-201ENST00000359238 TROAPQ12815 778 aa21.32■■□□□ 1
SNX11-201ENST00000359238 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SNX11-201ENST00000359238 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.32■■□□□ 1
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