RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 APPBP2Q92624 585 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.53□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.53□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
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CCL20-201ENST00000358813 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 SEZ6Q53EL9 994 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 HGSNATQ68CP4 663 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 KIF15Q9NS87 1388 aa7.47□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 PDPK1O15530 556 aa7.47□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 ITPKAP23677 461 aa7.47□□□□□ -1.21
CCL20-201ENST00000358813 CRKP46108 304 aa7.47□□□□□ -1.21
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