RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF18P17022 549 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 KLRK1P26718 216 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRR-202ENST00000342084 KCNQ4P56696 695 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 SEC23AQ15436 765 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF174Q15697 407 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 KRT222Q8N1A0 295 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRR-202ENST00000342084 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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PTPRR-202ENST00000342084 SLC51AQ86UW1 340 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRR-202ENST00000342084 USP17L21D6R901 530 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRR-202ENST00000342084 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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PTPRR-202ENST00000342084 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 TERF2Q15554 542 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 NPY5RQ15761 445 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 CTR9Q6PD62 1173 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-202ENST00000342084 TMTC2Q8N394 836 aa8.28□□□□□ -1.08
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